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密码子使用频率表

在密码子使用频率表工具中，包含了大肠杆菌、酵母菌（巴斯德毕赤酵母与酿酒酵母）、昆虫（草地贪夜蛾）和哺乳动物细胞（人类HEK细胞与黑线仓鼠CHO细胞以及小鼠NSO细胞）等表达系统的密码子使用频率表。选择表达系统并点击下方的“显示密码子使用频率列表”按钮即可以得到对应的密码子使用频率表。 如果您希望得到自己序列的密码子使用频率，请使用密码子使用频率计算工具


Escherichia coli 密码子使用频率列表来自kazusa数据库
遗传密码子列表: 标准遗传密码表

内容：[三联密码子] [氨基酸] [分数]  [频率：每一千] ([数量]) 

UUU F 0.57 22.2 ( 30462)  UCU S 0.15  8.4 ( 11512)  UAU Y 0.57 16.1 ( 22037)  UGU C 0.44  5.1 (  7016)
UUC F 0.43 16.5 ( 22705)  UCC S 0.15  8.6 ( 11802)  UAC Y 0.43 12.2 ( 16795)  UGC C 0.56  6.4 (  8797)
UUA L 0.13 13.8 ( 18894)  UCA S 0.12  7.0 (  9620)  UAA * 0.64  2.0 (  2765)  UGA * 0.29  0.9 (  1249)
UUG L 0.13 13.6 ( 18664)  UCG S 0.15  8.9 ( 12210)  UAG * 0.07  0.2 (   321)  UGG W 1.00 15.2 ( 20889)

CUU L 0.10 11.0 ( 15082)  CCU P 0.16  7.0 (  9540)  CAU H 0.57 13.0 ( 17791)  CGU R 0.38 21.0 ( 28866)
CUC L 0.10 11.1 ( 15272)  CCC P 0.12  5.5 (  7490)  CAC H 0.43  9.8 ( 13399)  CGC R 0.40 22.3 ( 30530)
CUA L 0.04  3.8 (  5266)  CCA P 0.19  8.4 ( 11569)  CAA Q 0.35 15.4 ( 21121)  CGA R 0.06  3.5 (  4810)
CUG L 0.50 53.1 ( 72898)  CCG P 0.53 23.4 ( 32080)  CAG Q 0.65 29.0 ( 39835)  CGG R 0.10  5.4 (  7401)

AUU I 0.51 30.4 ( 41644)  ACU T 0.16  8.8 ( 12119)  AAU N 0.45 17.6 ( 24106)  AGU S 0.15  8.7 ( 11924)
AUC I 0.42 25.2 ( 34568)  ACC T 0.44 23.5 ( 32265)  AAC N 0.55 21.6 ( 29581)  AGC S 0.28 16.1 ( 22067)
AUA I 0.07  4.2 (  5733)  ACA T 0.13  6.9 (  9452)  AAA K 0.76 33.6 ( 46116)  AGA R 0.04  2.0 (  2771)
AUG M 1.00 27.8 ( 38167)  ACG T 0.27 14.4 ( 19820)  AAG K 0.24 10.3 ( 14174)  AGG R 0.02  1.1 (  1496)

GUU V 0.26 18.2 ( 24991)  GCU A 0.16 15.2 ( 20813)  GAU D 0.63 32.2 ( 44217)  GGU G 0.34 24.7 ( 33875)
GUC V 0.22 15.3 ( 21050)  GCC A 0.27 25.7 ( 35252)  GAC D 0.37 19.1 ( 26270)  GGC G 0.41 29.8 ( 40849)
GUA V 0.15 10.9 ( 14901)  GCA A 0.21 20.1 ( 27567)  GAA E 0.69 39.7 ( 54431)  GGA G 0.11  7.9 ( 10774)
GUG V 0.37 26.3 ( 36108)  GCG A 0.36 33.9 ( 46524)  GAG E 0.31 18.0 ( 24629)  GGG G 0.15 11.0 ( 15115)

Coding GC 51.93% 1st letter GC 59.06% 2nd letter GC 40.67% 3rd letter GC 56.05%
注意：这些数据可能与kazusa数据库中的数据有所不同，因为kazusa在不断更新。

生物信息学工具

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