重复序列过多,会增加基因合成的难度。利用该基因重复序列计算器,可以查找出序列中重复序列的位置,并计算出序列的退火温度。
重复序列是指在基因组中不同位置出现的相同或对称性片段。重复序列在基因组中广泛存在,按照重复单元的排列方式,可将它分为串联重复序列和散在重复序列两大类,串联重复序列就是重复单元首位相连,串联在一起的重复序列,串列重复序列在基因表达,调控和遗传等方面起着十分重要的作用;散在重复序列是以散在方式分布在基因组中的序列,共有四类:长散在重复、短散在重复、反转录病毒转座子和转座子。
大量实验证明,重复序列富含大量遗传信息,是基因调控网络的组成部分。同时,重复序列可以通过染色体的异染色质化而关闭基因表达,高等生物中很大比率的间隔序列和重复序列,往往呈异染色质化,是不表达的;而编码序列呈常染色质化,是表达的。因此,在基因重组研究中进行重复序列的分析是十分必要的。
其它常用序列分析工具:抗原决定簇预测(v1) 、GC含量计算 、多肽或蛋白序列属性计算器
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